Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM30A4D0T7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM30A4D0T7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms