Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SSC5DA1L4H1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SSC5DA1L4H1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSC5DA1L4H1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSC5DA1L4H1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms