Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRDE2Q9H7Z3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms