Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRT80Q6KB66 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT80Q6KB66 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms