Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRS1Q15050 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRS1Q15050 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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