Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL9A3Q14050 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A3Q14050 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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