Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GPM6BQ13491 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPM6BQ13491 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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