Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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