Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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