Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms