Protein–RNA interactions for Protein: P40259

CD79B, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD79BP40259 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD79BP40259 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD79BP40259 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD79BP40259 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD79BP40259 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD79BP40259 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD79BP40259 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD79BP40259 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD79BP40259 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms