Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms