Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms