Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A3GALT2U3KPV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms