Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms