Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPC1L1Q9UHC9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms