Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms