Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms