Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCK3Q9BQ16 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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