Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRMS1LQ5PSV4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms