Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf17Q53FE4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms