Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms