Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GRIK5Q16478 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GRIK5Q16478 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK5Q16478 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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