Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXE3Q13461 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXE3Q13461 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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