Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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