Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms