Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms