Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms