Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC5Q9UQL6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms