Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABI3Q9P2A4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms