Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLXNA4Q9HCM2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms