Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAAF4Q8WXU2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms