Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00301Q8NCQ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms