Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RESTQ13127 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RESTQ13127 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RESTQ13127 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RESTQ13127 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RESTQ13127 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RESTQ13127 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RESTQ13127 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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