Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGAEP38570 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms