Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFTPDP35247 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms