Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPHA1P21709 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPHA1P21709 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms