Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms