Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms