Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EDIL3O43854 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EDIL3O43854 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms