Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms