Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CRXO43186 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CRXO43186 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRXO43186 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRXO43186 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRXO43186 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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