Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms