Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP1B4Q9UN42 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1B4Q9UN42 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms