Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUOX2Q9NRD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUOX2Q9NRD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms