Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms