Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TMEM254Q8TBM7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TMEM254Q8TBM7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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