Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms