Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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