Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNB1Q14721 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNB1Q14721 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms